На мехмате криптографией занимаются следующие люди и кафедры:
- Теория чисел (Нестеренко, Черепнев, Василенко).
- МаТИС (Носов В.А., Панкратьев А.Е.)
- Дискретная математика + лаборатория мат. проблем криптографии (Сидельников В.М.)
Каждая кафедра занимается своей ветвью, но тесно взаимодействует с наукой в целом. Подробнее - могу письмом:)
ВМК: насколько я знаю, основной упор делается на кафедре математической кибернетики (В.Б.Алексеев). Но там есть некоторый перекос в сторону программистских изысканий.
Кроме того, в к. 804 II гум находится кафедра защиты информации, совместно работающая на ВМК и мехмат. Там есть несколько очень интересных курсов, например Бабаша об автоматных оделях, Анашина о псевдослучайных генераторах, Зубова, Расторгуева и т.д. Действительно, стоит зайти и поговорить с Эдуардом Андреевичем Применко - вынесете много полезного.